中科院深圳先进院戴磊团队解析膳食纤维干预下肠道微生物小组的生态应答

所写：有机体世界

2022年5月21日，中都国科学院茂名现代化更为重要技术原始数据分析所制备病原体组学原始数据分析中都心、茂名制备分子有机体学创新原始数据分析所戴磊课题组在 ISME Journal上刊登题为： Ecological dynamics of the gut microbiome in response to dietary fiber 的原始数据分析论文。

原始数据分析一个团队基于十二指肠病原体组的连续性原始数据，重构午餐拉伸依赖性下十二指肠病原体的动态变化，为系统化理解十二指肠病原体组的有机体学规律性以及开发其所的灵巧碳水化合物依赖性技术手段奠定了重要基石。一个团队成员刘红宾教授和美国纪念斯隆-凯特妮癌症中都心廖辰教授为协同第一所写。

午餐拉伸对生理成年人症有着深远的影响，高午餐拉伸摄入量可增大成年人、炎症性肠病、结乳腺癌等多种疾病的风险。日渐多的证据暗示，对十二指肠病原体的依赖性是午餐拉伸造就其对生理成年人症有益于的重要途径。

都有的是，十二指肠病原体并不是许多各自独立的病原体凑在一起, 它是一个在资源竞争性、碳水化合物群聚和群体感应等相互抑制作用组态下演化成的多样生境系统。因此，在多样环境中都对特定病原体同步进行调节，不一定但会不止整个生境系统，病原体病原体的反之亦然变化很大程度上取决于病原体中间依赖于的竞争性、互惠等生境互作父子关系 （左图1） 。

左图1：病原体生境对十二指肠病原体反之亦然的影响

原始数据分析一个团队通过生境动力学假设，重构午餐拉伸干涉下十二指肠病原体反之亦然的有机体学组态。以广义Lotka-Volterra (gLV) 假设为框架，拟合激素十二指肠病原体在午餐拉伸干涉后的动态变化，推断出午餐拉伸干涉下生长速度有显著自发的更为重要病原体和不同病原体中间的互作父子关系。通过这一步骤，该一个团队成功推断出了激素十二指肠病原体中都午餐拉伸代谢物功能性的更为重要自发大肠杆菌，以及更为重要病原体中间的互作父子关系。当更为重要病原体局限性时，午餐拉伸对十二指肠病原体的依赖性抑制作用可能但会“失效” （左图2） 。

左图2：来同步进行生境动力学假设重构激素十二指肠病原体对菊粉干涉的自发

原始数据分析一个团队必要性将有机体学假设常用分析生理十二指肠病原体组在午餐拉伸干涉下的连续性原始数据，成功推断出出很强菊粉代谢物功能性的爱双歧杆大肠杆菌。此外，发现了爱双歧杆大肠杆菌与腐肉拟杆大肠杆菌中间依赖于的竞争性父子关系，并通过排泄养成实验同步进行了验证。比如，通过向十二指肠病原体中都补充爱双歧杆大肠杆菌，可以观察到腐肉拟杆大肠杆菌丰度的增高 （左图3） 。

左图3：生理十二指肠病原体在菊粉干涉下的更为重要大肠杆菌和互作验证

针对午餐拉伸干涉下十二指肠病原体的个性化反之亦然震荡，原始数据分析结合连续性原始数据与数学假设，熟悉重构十二指肠病原体的有机体学规律性。原始数据分析探究了病原体生境网络服务对于理解与预测十二指肠病原体反之亦然的重要性，为开发生境层级的抗病毒依赖性技术手段奠定了理论基石。

PI与课题组简介：

戴磊教授，所长，中都科院茂名现代化更为重要技术原始数据分析所制备分子有机体学原始数据分析所，制备病原体组学原始数据分析中都心主任。国家课题研发计划菁英项目负责人，入选为《麻省理工学院科技评论》中都国区“35岁以下科技创新35人”。

戴磊课题组的主要原始数据分析方向为宿主群聚病原体组的生境和趋同。运用定量分析分子有机体学、制备分子有机体学的工具，对病原体组的骨架和功能性同步进行灵巧重构和依赖性，致力于妥善解决生理成年人症、农业生产商等重大难题。

拟招聘很强微分子有机体学、制备分子有机体学、有机体信息学等之外原始数据分析故事情节教授后1-2名，副教授学生1-2名。决意申请者请将个人简历以邮件方式发送至 lei.dai@siat.ac.cn。

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